С гибелью Домициана в 96 г. и возвышением Нервы легион был «реабилитирован» (John D. Grainger: Nerva and the Roman succession crisis of AD 96–99, Routledge, London. 2003, - p. 113). Траян включил XIIII легион в состав корпуса, принявшего участие в Дакийских войнах 101-106 гг. С завершением войн с даками легион снова был переведён на Дунай, но на этот раз занимал не второстепенные крепости, а крупный город-форт, имевший огромное стратегическое значение - Карнунт, центр и торговый узел Верхнего Дуная. Не смотря на то, что этот город станет местом постоянной дислокации легиона, Антонины куда активнее, чем в прошлые времена применяли практики дробления легионов, вычленения из их состава вексилляций (András Mócsy: Pannonia and Upper Moesia: History of the Middle Danube Provinces of the Roman Empire. Routledge. 1974,- p. 92).
В частности, пока основная часть легиона продолжала нести гарнизонную службу в Карнунте, его когорты привлекались Антонином Пием (138-161 гг.) к участию в Мавританской войне ок. 140 г., Луцием Вером (161-169 гг.) в 161-166 гг. в парфянском походе. В Карнунте легион встретил начало Маркаманской войны (166-182 гг.). Нет точных сведений о состоянии легиона после крупного поражения римской армии под Карнунтом ок.170 г., однако маловероятно, что подразделение смогло уклониться от битвы, учитывая её локализацию прямо близ места дислокации легиона. Тем не менее, по меньшей мере часть легиона выжила и продолжила участие в Маркоманской войне. Вероятно, германцы не смогли взять Карнунт сходу и решили продвигаться вглубь провинций Реция и Норик, тогда как понёсший потери легион заперся в городе и хотя удержал Карнунт, не имел сил для контратак. В 170-ых гг., после успешного контрнаступления, Марк Аврелий (161-180 гг.) сделал Карнунт своей резиденцией и штабом для продолжения войны с германскими и сарматскими союзами (Alan K. Bowman, Peter Garnsey, Dominic Rathbone (Hrsg.): The Cambridge Ancient History. Vol. 11: The High Empire, A.D. 70–192. University Press. Cambridge. 2000,- p. 561-564).
Таким образом, можно предположить особое доверие Антонинов к легиону и его высокий статус. При Коммоде командиром Паннонийского корпуса легионов становится Септимий Север (император 193-211 гг.). Он, после гибели императора Коммода в результате заговора 192 г. и воцарившейся неразберихи, провозглашает себя восстановителем порядка Антонинов и в 193 г. идёт в Рим, где сенат признаёт его императором. Свою лояльность Северу выразил в том числе XIIII легион (Markus Handy: Die Severer und das Heer (Studien zur Alten Geschichte, Bd. 10), Antike Verlag. Berlin. 2009, - pp. 119–120).